FFU、高效过滤器的安装目前市场上的FFU有分体式和整体式两大类，但无论何种型式的FFU，在安装之前都需要注意：
洁净室内必须已经密闭，新风空调送洁净风需3天左右，且所有龙骨已经安装并调平。必须已经对洁净室进行全面清扫，避免污染过滤器，如技术夹层或吊顶内安装过滤器，则技术夹层或吊顶内也应进行全面的清扫、擦净。
即使使用的是分体式FFU，很多安装公司在现场会先安装头部进行空吹，但事实上这并不能够替代对洁净室的全面清洁工作，否则将影响高效过滤器的使用寿命。在FFU试运行阶段，为了避免由于洁净室清洁的不够彻底，防止高效过滤器被污染，可以在FFU的进风口放置无纺布或者初效过滤器。
(1)施工人员进入清洁好的洁净室内，应穿戴洁净服装，洁净鞋帽，避免二次污染。过滤器应该在洁净室内打开内部塑料包装。
(2)应在建设单位、监理单位、或者过滤器厂家等有关方(第三方)参加下进行FFU的开箱检查，并做好开箱或验收记录。
拆开过滤器的塑料包装之前，施工人员务必仔细检查过滤器外观，特别是滤芯有无物理破损、变形;如发现设备有瑕疵，安装方应第一时间向厂方或者业主反映;否则，其责任将由安装方承担。
(3)从封闭的塑料包装中取出过滤器时，操作者双手需要配戴无尘手套，双手不允许触摸过滤器保护网板;在搬运、安装HEPA/ULPA过滤器的过程中，应轻拿轻避免过滤器剧烈震动和碰撞损伤过滤器。
(4)在撕开塑料袋时，禁止在过滤器网板面使用金属器具，类似美工刀等。
(5)过滤器在搬运过程中，尽量避免使用小车，而应该尽量安排两人抓住过滤器外框边缘的方法搬运;在条件限制、万不得已情况下使用小车进行短途搬运时，必须保证过滤器不受任何外力损坏;不能横放堆积。
(6)过滤器在洁净室临时储存时，应该采取垂直地面方式摆放;
严禁平放或斜放，否则将可能导致过滤器失效。
(7)安装之前，应该仔细检查过滤器标签细节是否与实际要求的尺寸、效率等一致;并注意气流方向。
安装后过滤器四周和接口，应严密不漏。
(8)安装时，建议每组安装人员数量为6人，推荐使用升降机实施FFU的现场安装。
FFU的安装方向必须正确，安装后的FFU应方便维修。
在安装过程中，过滤器网板和滤纸表面严禁承受任何外力，否则将会导致过滤器失效。过滤器安装到位后，应避免再次移动或搬运，严禁任何物体或手接触过滤器表面，否则将引起过滤器的失效。
安装后的检测
(1)高效空气过滤器安装后的检漏是确认过滤器及安装是否合格的关键。
重点检测高效空气过滤器送风口的整个面、过滤器的周边、过滤器外框和安装框架之间的密封处。
检漏时，从过滤器的上风侧引入测试气溶胶，并立即在其下风侧进行检测。
该项测试一般在洁净室(区)的“空态”或“静态”进行。此项检测一般不判定系统的过滤效率。
(2)高效空气过滤器安装后的检漏方法有光度计法和粒子计数器法。
光度计法一般用于带小型空气处理系统的洁净室或安装有气溶胶注入点的管路系统，可达到规定的高浓度测试气溶胶，此方法的缺点是容易造成二次污染。
由于粒子计数器法的灵敏性好和污染少，行业里一般都采用粒子计数器法进行高效空气过滤器安装后的检漏。
(3)过滤器制造厂内的效率检测是在理想实验条件下进行的，现场条件与实验条件与制造厂条件的差别，可能造成现场检验与实验室检验的结果不一致。
